Me tope con un archivo partido con Hacha Pro y o sorpresa el hacha que venia usando con wine no me saco del lío, el Hacha pro requiere las librerías net y siendo franco no tenia tiempo de pelearme con librerías o cosas así. Googleando encontré Dalle, un ¿clon de hacha para linux? quien sabe, lo que si les digo es que pude unir mis archivos sin ningún problema, nativo en linux y sin emular nada.
Pagina para descargar el programa: